Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms