Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND1BQ6P3S1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND1BQ6P3S1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms