Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOHLH1Q5JUK2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SOHLH1Q5JUK2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms