Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZIK1Q3SY52 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIK1Q3SY52 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms