Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP3M2P53677 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3M2P53677 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms