Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP5P51878 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP5P51878 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP5P51878 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP5P51878 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP5P51878 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP5P51878 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP5P51878 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP5P51878 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP5P51878 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP5P51878 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP5P51878 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP5P51878 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP5P51878 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP5P51878 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP5P51878 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP5P51878 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP5P51878 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP5P51878 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP5P51878 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP5P51878 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP5P51878 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP5P51878 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP5P51878 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP5P51878 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP5P51878 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP5P51878 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP5P51878 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP5P51878 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP5P51878 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP5P51878 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP5P51878 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP5P51878 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP5P51878 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP5P51878 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP5P51878 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP5P51878 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP5P51878 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP5P51878 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP5P51878 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP5P51878 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP5P51878 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP5P51878 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP5P51878 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP5P51878 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP5P51878 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP5P51878 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP5P51878 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP5P51878 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP5P51878 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP5P51878 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP5P51878 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP5P51878 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP5P51878 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP5P51878 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP5P51878 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP5P51878 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP5P51878 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP5P51878 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP5P51878 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP5P51878 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP5P51878 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP5P51878 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP5P51878 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP5P51878 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP5P51878 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP5P51878 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP5P51878 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP5P51878 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP5P51878 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP5P51878 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP5P51878 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP5P51878 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP5P51878 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASP5P51878 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASP5P51878 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP5P51878 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP5P51878 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP5P51878 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP5P51878 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP5P51878 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP5P51878 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP5P51878 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP5P51878 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP5P51878 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP5P51878 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP5P51878 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP5P51878 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP5P51878 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP5P51878 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP5P51878 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP5P51878 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP5P51878 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP5P51878 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP5P51878 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP5P51878 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP5P51878 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP5P51878 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP5P51878 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP5P51878 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms