Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00271P0C7V0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00271P0C7V0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms