Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC17A6Q9P2U8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC17A6Q9P2U8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms