Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS4Q9NQG7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.8 ms