Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 PRSS21-210ENST00000577043 814 ntTSL 520.72■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 29.4
PCBP1Q15365 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.959e-8■■■■■ 29.3
PCBP1Q15365 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.279e-8■■■■■ 29.3
PCBP1Q15365 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.049e-8■■■■■ 29.3
PCBP1Q15365 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.239e-8■■■■■ 29.3
PCBP1Q15365 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.299e-8■■■■■ 29.3
PCBP1Q15365 NFE2L1-202ENST00000361665 4729 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.379e-8■■■■■ 29.3
PCBP1Q15365 NFE2L1-201ENST00000357480 4672 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.549e-8■■■■■ 29.3
PCBP1Q15365 CYP2W1-203ENST00000415893 890 ntTSL 320.14■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 29.3
PCBP1Q15365 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.252e-10■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.262e-10■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 DAZAP1-209ENST00000590419 508 ntTSL 316.17■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.324e-7■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.954e-7■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.944e-7■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 SPNS1-206ENST00000564476 890 ntTSL 320.7■□□□□ 0.95e-7■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 SPNS1-208ENST00000566059 1615 ntTSL 519.77■□□□□ 0.765e-7■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.724e-7■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 SPNS1-211ENST00000568829 780 ntTSL 518.58■□□□□ 0.565e-7■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 LRRC41-204ENST00000496156 892 ntTSL 512.47□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 LRRC41-207ENST00000617190 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 LRRC41-203ENST00000472710 4455 ntTSL 210.45□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 MDK-209ENST00000489525 1339 ntTSL 527.01■■□□□ 1.912e-11■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.832e-11■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.752e-11■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.72e-11■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.332e-11■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.242e-11■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.092e-11■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.962e-11■■■■■ 29.2
PCBP1Q15365 SAMD4B-206ENST00000596368 1176 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.428e-8■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 LDB1-204ENST00000490751 762 ntTSL 234.84■■■■□ 3.172e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.132e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 MARK4-209ENST00000592762 683 ntTSL 527.55■■■□□ 22e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 MGAT4B-221ENST00000523108 1080 ntTSL 524.54■■□□□ 1.522e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.382e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 MGAT4B-205ENST00000518778 1568 ntTSL 1 (best)23.44■■□□□ 1.342e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 ZNF646-203ENST00000428260 1077 ntTSL 322.52■■□□□ 1.22e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 MGAT4B-209ENST00000519836 1686 ntTSL 1 (best)21.97■■□□□ 1.112e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 MGAT4B-217ENST00000521305 1213 ntTSL 520.82■□□□□ 0.922e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.892e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 CTTN-204ENST00000393747 1315 ntTSL 520■□□□□ 0.791e-13■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 ZNF646-204ENST00000564189 582 ntTSL 219.51■□□□□ 0.712e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.682e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.621e-13■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 CTTN-212ENST00000527962 587 ntTSL 217.62■□□□□ 0.411e-13■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.22e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 MARK4-203ENST00000587566 553 ntTSL 515.77■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.112e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 MGAT4B-213ENST00000520822 745 ntTSL 215.7■□□□□ 0.12e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.041e-13■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 MGAT4B-215ENST00000520918 799 ntTSL 315.18■□□□□ 0.022e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.222e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 CTTN-210ENST00000525852 1470 ntTSL 513.6□□□□□ -0.231e-13■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.241e-13■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 MGAT4B-214ENST00000520875 964 ntTSL 512.78□□□□□ -0.362e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 MGAT4B-223ENST00000523382 778 ntTSL 312.78□□□□□ -0.362e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 CTTN-208ENST00000498223 523 ntTSL 312.56□□□□□ -0.41e-13■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.432e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 MGAT4B-206ENST00000518867 732 ntTSL 59.45□□□□□ -0.92e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 MGAT4B-204ENST00000518702 542 ntTSL 39.26□□□□□ -0.932e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 MGAT4B-207ENST00000518980 983 ntTSL 58.64□□□□□ -1.032e-9■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 513.19□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)11.13□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 29.1
PCBP1Q15365 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.83e-7■■■■■ 29
PCBP1Q15365 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.353e-7■■■■■ 29
PCBP1Q15365 ZBTB44-205ENST00000525842 9315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 29
PCBP1Q15365 ARFGAP1-208ENST00000518691 1162 ntTSL 221.5■■□□□ 1.035e-12■■■■■ 28.9
PCBP1Q15365 ARFGAP1-213ENST00000520022 558 ntTSL 419.44■□□□□ 0.75e-12■■■■■ 28.9
PCBP1Q15365 ARFGAP1-209ENST00000518794 2727 ntTSL 1 (best)18.18■□□□□ 0.52e-9■■■■■ 28.9
PCBP1Q15365 ARFGAP1-205ENST00000468975 2640 ntTSL 217.32■□□□□ 0.365e-12■■■■■ 28.9
PCBP1Q15365 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 28.9
PCBP1Q15365 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 28.9
PCBP1Q15365 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 28.9
PCBP1Q15365 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 28.9
PCBP1Q15365 PPP2R5E-203ENST00000553266 1690 ntTSL 1 (best)21.1■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 28.9
PCBP1Q15365 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 28.9
PCBP1Q15365 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.142e-7■■■■■ 28.8
PCBP1Q15365 TSG101-210ENST00000545247 783 ntTSL 321.18■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 28.8
PCBP1Q15365 TSG101-202ENST00000438874 581 ntTSL 1 (best)20.92■□□□□ 0.943e-7■■■■■ 28.8
PCBP1Q15365 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.933e-7■■■■■ 28.8
PCBP1Q15365 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 28.8
PCBP1Q15365 TSG101-209ENST00000544804 391 ntTSL 316.75■□□□□ 0.273e-7■■■■■ 28.8
PCBP1Q15365 TSG101-208ENST00000543087 714 ntTSL 314.47□□□□□ -0.093e-7■■■■■ 28.8
PCBP1Q15365 TSG101-207ENST00000543054 593 ntTSL 26.4□□□□□ -1.383e-7■■■■■ 28.8
PCBP1Q15365 CHKB-210ENST00000484266 1401 ntTSL 236.34■■■■□ 3.413e-6■■■■■ 28.8
PCBP1Q15365 CHKB-207ENST00000476289 1010 ntTSL 535.73■■■■□ 3.313e-6■■■■■ 28.8
PCBP1Q15365 CHKB-212ENST00000492582 2069 ntTSL 230.29■■■□□ 2.443e-6■■■■■ 28.8
PCBP1Q15365 CHKB-208ENST00000479003 2114 ntTSL 228.77■■■□□ 2.23e-6■■■■■ 28.8
PCBP1Q15365 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 28.8
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