RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489525.5

MDK-209, Transcript of midkine, humanhuman

TSL 5

Gene MDK, Length 1,339 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDK-209ENST00000489525 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.56■■■■■ 6.97
MDK-209ENST00000489525 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.8■■■■■ 5.88
MDK-209ENST00000489525 ABCC9O60706 1549 aa49.98■■■■■ 5.59
MDK-209ENST00000489525 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.94■■■■■ 5.43
MDK-209ENST00000489525 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.54■■■■■ 5.36
MDK-209ENST00000489525 NACADO15069 1562 aa48.54■■■■■ 5.36
MDK-209ENST00000489525 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.53■■■■■ 5.36
MDK-209ENST00000489525 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.46■■■■■ 5.35
MDK-209ENST00000489525 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.41■■■■■ 5.34
MDK-209ENST00000489525 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.33■■■■■ 5.17
MDK-209ENST00000489525 SCRIBQ14160 1630 aa47.24■■■■■ 5.15
MDK-209ENST00000489525 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.98■■■■■ 5.11
MDK-209ENST00000489525 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.78■■■■■ 5.08
MDK-209ENST00000489525 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.58■■■■■ 5.05
MDK-209ENST00000489525 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.66■■■■■ 4.9
MDK-209ENST00000489525 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.52■■■■■ 4.88
MDK-209ENST00000489525 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.34■■■■■ 4.85
MDK-209ENST00000489525 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.33■■■■■ 4.85
MDK-209ENST00000489525 SMARCA4P51532 1647 aa45.3■■■■■ 4.84
MDK-209ENST00000489525 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.29■■■■■ 4.84
MDK-209ENST00000489525 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.13■■■■■ 4.81
MDK-209ENST00000489525 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.91■■■■■ 4.78
MDK-209ENST00000489525 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.9■■■■■ 4.78
MDK-209ENST00000489525 SMARCA2P51531 1590 aa44.87■■■■■ 4.77
MDK-209ENST00000489525 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.85■■■■■ 4.77
MDK-209ENST00000489525 NCAPD3P42695 1498 aa44.8■■■■■ 4.76
MDK-209ENST00000489525 WIZO95785 1651 aa44.65■■■■■ 4.74
MDK-209ENST00000489525 HMGXB3Q12766 1538 aa44.64■■■■■ 4.74
MDK-209ENST00000489525 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.53■■■■■ 4.72
MDK-209ENST00000489525 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.25■■■■■ 4.67
MDK-209ENST00000489525 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.02■■■■■ 4.64
MDK-209ENST00000489525 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.71■■■■■ 4.59
MDK-209ENST00000489525 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.5■■■■■ 4.55
MDK-209ENST00000489525 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.49■■■■■ 4.55
MDK-209ENST00000489525 NESP48681 1621 aa43.47■■■■■ 4.55
MDK-209ENST00000489525 CFTRP13569 1480 aa43.4■■■■■ 4.54
MDK-209ENST00000489525 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.14■■■■■ 4.5
MDK-209ENST00000489525 PRDM2Q13029 1718 aa43.09■■■■■ 4.49
MDK-209ENST00000489525 ERCC6Q03468 1493 aa43.01■■■■■ 4.48
MDK-209ENST00000489525 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.98■■■■■ 4.47
MDK-209ENST00000489525 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.98■■■■■ 4.47
MDK-209ENST00000489525 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.86■■■■■ 4.45
MDK-209ENST00000489525 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
MDK-209ENST00000489525 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.68■■■■■ 4.42
MDK-209ENST00000489525 WDR62O43379 1518 aa42.56■■■■■ 4.4
MDK-209ENST00000489525 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
MDK-209ENST00000489525 CUX2O14529 1486 aa42.42■■■■■ 4.38
MDK-209ENST00000489525 ABCC8Q09428 1581 aa42.42■■■■■ 4.38
MDK-209ENST00000489525 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.39■■■■■ 4.38
MDK-209ENST00000489525 TOPBP1Q92547 1522 aa42.37■■■■■ 4.37
MDK-209ENST00000489525 CUX1P39880 1505 aa42.3■■■■■ 4.36
MDK-209ENST00000489525 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.24■■■■■ 4.35
MDK-209ENST00000489525 SYNJ1O43426 1573 aa42.12■■■■■ 4.33
MDK-209ENST00000489525 TOP2BQ02880 1626 aa42.11■■■■■ 4.33
MDK-209ENST00000489525 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.11■■■■■ 4.33
MDK-209ENST00000489525 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.06■■■■■ 4.32
MDK-209ENST00000489525 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.04■■■■■ 4.32
MDK-209ENST00000489525 IFT140Q96RY7 1462 aa41.96■■■■■ 4.31
MDK-209ENST00000489525 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
MDK-209ENST00000489525 SOGA1O94964 1423 aa41.86■■■■■ 4.29
MDK-209ENST00000489525 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.84■■■■■ 4.29
MDK-209ENST00000489525 WDR97A6NE52 1622 aa41.71■■■■■ 4.27
MDK-209ENST00000489525 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.7■■■■■ 4.27
MDK-209ENST00000489525 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
MDK-209ENST00000489525 TRIM41Q8WV44 630 aa41.59■■■■■ 4.25
MDK-209ENST00000489525 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
MDK-209ENST00000489525 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.55■■■■■ 4.24
MDK-209ENST00000489525 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
MDK-209ENST00000489525 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.52■■■■■ 4.241e-9■■■■■ 32.7
MDK-209ENST00000489525 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.49■■■■■ 4.23
MDK-209ENST00000489525 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.41■■■■■ 4.22
MDK-209ENST00000489525 GRIN2BQ13224 1484 aa41.32■■■■■ 4.21
MDK-209ENST00000489525 KIF27Q86VH2 1401 aa41.29■■■■■ 4.2
MDK-209ENST00000489525 PBRM1Q86U86 1689 aa41.28■■■■■ 4.2
MDK-209ENST00000489525 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.21■■■■■ 4.19
MDK-209ENST00000489525 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.17■■■■■ 4.18
MDK-209ENST00000489525 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
MDK-209ENST00000489525 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.12■■■■■ 4.17
MDK-209ENST00000489525 IGF1RP08069 1367 aa41.08■■■■■ 4.17
MDK-209ENST00000489525 ADAMTS12P58397 1594 aa41.03■■■■■ 4.16
MDK-209ENST00000489525 SYNJ2O15056 1496 aa40.99■■■■■ 4.15
MDK-209ENST00000489525 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.97■■■■■ 4.15
MDK-209ENST00000489525 EEA1Q15075 1411 aa40.96■■■■■ 4.15
MDK-209ENST00000489525 CUL7Q14999 1698 aa40.94■■■■■ 4.14
MDK-209ENST00000489525 CHD1O14646 1710 aa40.9■■■■■ 4.14
MDK-209ENST00000489525 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
MDK-209ENST00000489525 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.81■■■■■ 4.12
MDK-209ENST00000489525 GRIN2AQ12879 1464 aa40.8■■■■■ 4.12
MDK-209ENST00000489525 FBLN2P98095 1184 aa40.79■■■■■ 4.12
MDK-209ENST00000489525 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.75■■■■■ 4.11
MDK-209ENST00000489525 PRXQ9BXM0 1461 aa40.72■■■■■ 4.11
MDK-209ENST00000489525 OSCARQ8IYS5 282 aa40.7■■■■■ 4.11
MDK-209ENST00000489525 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.66■■■■■ 4.1
MDK-209ENST00000489525 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
MDK-209ENST00000489525 NUP160Q12769 1436 aa40.63■■■■■ 4.09
MDK-209ENST00000489525 CEP170Q5SW79 1584 aa40.58■■■■■ 4.09
MDK-209ENST00000489525 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.54■■■■■ 4.08
MDK-209ENST00000489525 KIF21BO75037 1637 aa40.49■■■■■ 4.07
MDK-209ENST00000489525 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.37■■■■■ 4.05
MDK-209ENST00000489525 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.34■■■■■ 4.05
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