Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSHL1Q14406 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSHL1Q14406 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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