Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms