Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA3P42263 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms