Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms