Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF19Q5T6S3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms