Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A2P43004 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms