Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A1Q8WWI5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A1Q8WWI5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A1Q8WWI5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A1Q8WWI5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC44A1Q8WWI5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC44A1Q8WWI5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC44A1Q8WWI5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms