Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD35Q8N283 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD35Q8N283 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD35Q8N283 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD35Q8N283 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD35Q8N283 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD35Q8N283 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD35Q8N283 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD35Q8N283 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD35Q8N283 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD35Q8N283 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD35Q8N283 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD35Q8N283 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ANKRD35Q8N283 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ANKRD35Q8N283 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ANKRD35Q8N283 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD35Q8N283 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ANKRD35Q8N283 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ANKRD35Q8N283 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ANKRD35Q8N283 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ANKRD35Q8N283 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD35Q8N283 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms