Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTU1Q7Z7A3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CTU1Q7Z7A3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTU1Q7Z7A3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms