Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX3Q13761 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNX3Q13761 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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