Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIGQ13278 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RIGQ13278 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RIGQ13278 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIGQ13278 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIGQ13278 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIGQ13278 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIGQ13278 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIGQ13278 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIGQ13278 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIGQ13278 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIGQ13278 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIGQ13278 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RIGQ13278 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIGQ13278 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIGQ13278 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIGQ13278 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIGQ13278 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIGQ13278 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIGQ13278 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIGQ13278 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIGQ13278 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIGQ13278 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIGQ13278 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIGQ13278 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIGQ13278 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIGQ13278 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIGQ13278 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIGQ13278 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIGQ13278 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIGQ13278 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIGQ13278 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIGQ13278 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIGQ13278 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIGQ13278 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIGQ13278 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RIGQ13278 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIGQ13278 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIGQ13278 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIGQ13278 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIGQ13278 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIGQ13278 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIGQ13278 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIGQ13278 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIGQ13278 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIGQ13278 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIGQ13278 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIGQ13278 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIGQ13278 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIGQ13278 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIGQ13278 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIGQ13278 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIGQ13278 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIGQ13278 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIGQ13278 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIGQ13278 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIGQ13278 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIGQ13278 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIGQ13278 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIGQ13278 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIGQ13278 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIGQ13278 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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