Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC36.57■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
GRIN2AQ12879 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GRIN2AQ12879 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms