Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APODP05090 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APODP05090 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APODP05090 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APODP05090 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APODP05090 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APODP05090 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APODP05090 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APODP05090 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APODP05090 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APODP05090 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APODP05090 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APODP05090 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APODP05090 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APODP05090 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APODP05090 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APODP05090 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APODP05090 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APODP05090 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APODP05090 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APODP05090 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APODP05090 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APODP05090 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APODP05090 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APODP05090 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APODP05090 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APODP05090 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APODP05090 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APODP05090 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APODP05090 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APODP05090 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APODP05090 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APODP05090 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APODP05090 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APODP05090 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APODP05090 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APODP05090 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APODP05090 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APODP05090 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APODP05090 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APODP05090 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APODP05090 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APODP05090 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APODP05090 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APODP05090 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APODP05090 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APODP05090 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APODP05090 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APODP05090 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APODP05090 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APODP05090 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APODP05090 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APODP05090 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APODP05090 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APODP05090 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APODP05090 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APODP05090 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APODP05090 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APODP05090 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APODP05090 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APODP05090 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APODP05090 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APODP05090 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APODP05090 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APODP05090 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APODP05090 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APODP05090 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APODP05090 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APODP05090 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APODP05090 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APODP05090 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APODP05090 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APODP05090 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APODP05090 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APODP05090 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APODP05090 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APODP05090 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APODP05090 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APODP05090 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APODP05090 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APODP05090 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms