Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF2P04141 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF2P04141 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF2P04141 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF2P04141 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF2P04141 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF2P04141 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSF2P04141 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSF2P04141 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSF2P04141 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSF2P04141 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSF2P04141 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSF2P04141 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF2P04141 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF2P04141 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF2P04141 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF2P04141 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF2P04141 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF2P04141 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF2P04141 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF2P04141 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF2P04141 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF2P04141 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF2P04141 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF2P04141 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF2P04141 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF2P04141 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF2P04141 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF2P04141 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF2P04141 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF2P04141 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF2P04141 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF2P04141 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF2P04141 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF2P04141 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF2P04141 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF2P04141 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF2P04141 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF2P04141 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF2P04141 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF2P04141 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF2P04141 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF2P04141 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF2P04141 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF2P04141 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF2P04141 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF2P04141 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF2P04141 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF2P04141 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF2P04141 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF2P04141 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF2P04141 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF2P04141 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF2P04141 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF2P04141 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF2P04141 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF2P04141 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF2P04141 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF2P04141 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF2P04141 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF2P04141 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF2P04141 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF2P04141 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF2P04141 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF2P04141 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF2P04141 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF2P04141 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF2P04141 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF2P04141 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF2P04141 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF2P04141 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF2P04141 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF2P04141 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF2P04141 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF2P04141 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF2P04141 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF2P04141 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF2P04141 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF2P04141 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF2P04141 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF2P04141 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF2P04141 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF2P04141 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF2P04141 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF2P04141 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF2P04141 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF2P04141 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF2P04141 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF2P04141 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF2P04141 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSF2P04141 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSF2P04141 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSF2P04141 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSF2P04141 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CSF2P04141 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSF2P04141 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSF2P04141 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSF2P04141 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSF2P04141 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSF2P04141 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms