Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1D8

PRO2289, Putative uncharacterized protein PRO2289, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO2289Q9P1D8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PRO2289Q9P1D8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms