Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP30Q70CQ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms