Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC10A1Q14973 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC10A1Q14973 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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