Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIAQ12857 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIAQ12857 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
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