Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP1P59025 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP1P59025 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP1P59025 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP1P59025 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP1P59025 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP1P59025 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP1P59025 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP1P59025 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP1P59025 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP1P59025 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP1P59025 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP1P59025 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP1P59025 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP1P59025 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP1P59025 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP1P59025 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP1P59025 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP1P59025 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP1P59025 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP1P59025 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP1P59025 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP1P59025 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP1P59025 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP1P59025 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP1P59025 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP1P59025 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP1P59025 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP1P59025 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP1P59025 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP1P59025 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP1P59025 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP1P59025 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP1P59025 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP1P59025 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP1P59025 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP1P59025 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP1P59025 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTP1P59025 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTP1P59025 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTP1P59025 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTP1P59025 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTP1P59025 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTP1P59025 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTP1P59025 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP1P59025 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP1P59025 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP1P59025 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP1P59025 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP1P59025 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP1P59025 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP1P59025 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP1P59025 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP1P59025 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP1P59025 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP1P59025 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP1P59025 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP1P59025 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP1P59025 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP1P59025 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP1P59025 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP1P59025 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTP1P59025 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTP1P59025 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTP1P59025 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTP1P59025 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTP1P59025 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTP1P59025 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTP1P59025 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP1P59025 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP1P59025 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP1P59025 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP1P59025 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP1P59025 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP1P59025 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP1P59025 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP1P59025 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP1P59025 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP1P59025 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP1P59025 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP1P59025 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP1P59025 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP1P59025 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP1P59025 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP1P59025 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP1P59025 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP1P59025 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP1P59025 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP1P59025 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP1P59025 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP1P59025 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP1P59025 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP1P59025 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP1P59025 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP1P59025 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP1P59025 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP1P59025 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP1P59025 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP1P59025 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP1P59025 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms