Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGA1P17096 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGA1P17096 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215 ms