Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP3P08254 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP3P08254 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP3P08254 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP3P08254 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP3P08254 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP3P08254 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP3P08254 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP3P08254 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP3P08254 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP3P08254 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP3P08254 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP3P08254 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP3P08254 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP3P08254 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP3P08254 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP3P08254 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP3P08254 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP3P08254 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP3P08254 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP3P08254 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP3P08254 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP3P08254 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP3P08254 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP3P08254 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MMP3P08254 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MMP3P08254 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP3P08254 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP3P08254 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP3P08254 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP3P08254 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP3P08254 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP3P08254 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP3P08254 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP3P08254 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP3P08254 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP3P08254 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP3P08254 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP3P08254 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP3P08254 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP3P08254 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP3P08254 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP3P08254 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP3P08254 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP3P08254 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP3P08254 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP3P08254 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP3P08254 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP3P08254 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP3P08254 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP3P08254 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP3P08254 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP3P08254 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP3P08254 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP3P08254 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP3P08254 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP3P08254 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP3P08254 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP3P08254 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP3P08254 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP3P08254 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP3P08254 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP3P08254 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP3P08254 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP3P08254 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP3P08254 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP3P08254 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP3P08254 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP3P08254 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP3P08254 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP3P08254 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP3P08254 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP3P08254 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP3P08254 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP3P08254 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP3P08254 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP3P08254 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP3P08254 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP3P08254 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP3P08254 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP3P08254 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP3P08254 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP3P08254 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP3P08254 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP3P08254 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP3P08254 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP3P08254 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP3P08254 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP3P08254 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP3P08254 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP3P08254 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP3P08254 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP3P08254 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP3P08254 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP3P08254 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP3P08254 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP3P08254 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP3P08254 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP3P08254 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP3P08254 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms