Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LEMD3Q9Y2U8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LEMD3Q9Y2U8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LEMD3Q9Y2U8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LEMD3Q9Y2U8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LEMD3Q9Y2U8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LEMD3Q9Y2U8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LEMD3Q9Y2U8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LEMD3Q9Y2U8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LEMD3Q9Y2U8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LEMD3Q9Y2U8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LEMD3Q9Y2U8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LEMD3Q9Y2U8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LEMD3Q9Y2U8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LEMD3Q9Y2U8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LEMD3Q9Y2U8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LEMD3Q9Y2U8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LEMD3Q9Y2U8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms