Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q3C1V9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q3C1V9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q3C1V9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q3C1V9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q3C1V9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q3C1V9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q3C1V9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q3C1V9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q3C1V9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q3C1V9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q3C1V9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q3C1V9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Q3C1V9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q3C1V9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q3C1V9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q3C1V9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Q3C1V9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q3C1V9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Q3C1V9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Q3C1V9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3C1V9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3C1V9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3C1V9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3C1V9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3C1V9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3C1V9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3C1V9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3C1V9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3C1V9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3C1V9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3C1V9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3C1V9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q3C1V9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q3C1V9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q3C1V9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q3C1V9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q3C1V9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q3C1V9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q3C1V9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q3C1V9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q3C1V9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q3C1V9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Q3C1V9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q3C1V9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q3C1V9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Q3C1V9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3C1V9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3C1V9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3C1V9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3C1V9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3C1V9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3C1V9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3C1V9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3C1V9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3C1V9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3C1V9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3C1V9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3C1V9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q3C1V9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q3C1V9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q3C1V9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q3C1V9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q3C1V9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q3C1V9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q3C1V9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3C1V9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3C1V9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3C1V9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3C1V9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3C1V9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3C1V9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3C1V9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3C1V9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3C1V9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3C1V9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q3C1V9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q3C1V9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q3C1V9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q3C1V9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3C1V9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3C1V9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3C1V9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3C1V9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3C1V9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3C1V9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3C1V9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3C1V9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3C1V9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3C1V9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3C1V9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3C1V9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3C1V9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3C1V9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3C1V9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3C1V9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3C1V9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3C1V9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3C1V9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3C1V9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms