Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF1Q14990 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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