RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306732.7

PITX2-201, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX2, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-201ENST00000306732 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.76■■■■□ 3.96
PITX2-201ENST00000306732 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.23■■■■□ 3.07
PITX2-201ENST00000306732 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.97■■■■□ 3.03
PITX2-201ENST00000306732 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
PITX2-201ENST00000306732 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
PITX2-201ENST00000306732 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.1■■■□□ 2.89
PITX2-201ENST00000306732 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.02■■■□□ 2.88
PITX2-201ENST00000306732 HRCP23327 699 aa32.8■■■□□ 2.84
PITX2-201ENST00000306732 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.77■■■□□ 2.84
PITX2-201ENST00000306732 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.74■■■□□ 2.83
PITX2-201ENST00000306732 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.5■■■□□ 2.79
PITX2-201ENST00000306732 ABCC9O60706 1549 aa32.19■■■□□ 2.74
PITX2-201ENST00000306732 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.73
PITX2-201ENST00000306732 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.11■■■□□ 2.73
PITX2-201ENST00000306732 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
PITX2-201ENST00000306732 SCRIBQ14160 1630 aa31.64■■■□□ 2.66
PITX2-201ENST00000306732 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
PITX2-201ENST00000306732 NACADO15069 1562 aa31.41■■■□□ 2.62
PITX2-201ENST00000306732 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.35■■■□□ 2.61
PITX2-201ENST00000306732 TRIM41Q8WV44 630 aa31.35■■■□□ 2.61
PITX2-201ENST00000306732 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
PITX2-201ENST00000306732 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
PITX2-201ENST00000306732 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.97■■■□□ 2.55
PITX2-201ENST00000306732 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.95■■■□□ 2.55
PITX2-201ENST00000306732 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.87■■■□□ 2.53
PITX2-201ENST00000306732 WIZO95785 1651 aa30.74■■■□□ 2.51
PITX2-201ENST00000306732 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
PITX2-201ENST00000306732 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
PITX2-201ENST00000306732 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
PITX2-201ENST00000306732 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.52■■■□□ 2.48
PITX2-201ENST00000306732 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.43■■■□□ 2.46
PITX2-201ENST00000306732 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
PITX2-201ENST00000306732 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
PITX2-201ENST00000306732 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
PITX2-201ENST00000306732 SMARCA4P51532 1647 aa30.32■■■□□ 2.44
PITX2-201ENST00000306732 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
PITX2-201ENST00000306732 ABCC8Q09428 1581 aa30.25■■■□□ 2.43
PITX2-201ENST00000306732 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.22■■■□□ 2.43
PITX2-201ENST00000306732 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.21■■■□□ 2.43
PITX2-201ENST00000306732 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.16■■■□□ 2.42
PITX2-201ENST00000306732 CEP162Q5TB80 1403 aa30.11■■■□□ 2.41
PITX2-201ENST00000306732 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
PITX2-201ENST00000306732 SMARCA2P51531 1590 aa30.09■■■□□ 2.41
PITX2-201ENST00000306732 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
PITX2-201ENST00000306732 SOGA1O94964 1423 aa30.05■■■□□ 2.4
PITX2-201ENST00000306732 NEUROD1Q13562 356 aa30.02■■■□□ 2.4
PITX2-201ENST00000306732 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
PITX2-201ENST00000306732 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.98■■■□□ 2.39
PITX2-201ENST00000306732 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.89■■■□□ 2.38
PITX2-201ENST00000306732 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.85■■■□□ 2.37
PITX2-201ENST00000306732 EEA1Q15075 1411 aa29.85■■■□□ 2.37
PITX2-201ENST00000306732 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.83■■■□□ 2.37
PITX2-201ENST00000306732 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
PITX2-201ENST00000306732 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
PITX2-201ENST00000306732 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.76■■■□□ 2.35
PITX2-201ENST00000306732 GOLGA3Q08378 1498 aa29.74■■■□□ 2.35
PITX2-201ENST00000306732 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
PITX2-201ENST00000306732 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.57■■■□□ 2.32
PITX2-201ENST00000306732 SYNJ1O43426 1573 aa29.5■■■□□ 2.31
PITX2-201ENST00000306732 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.5■■■□□ 2.31
PITX2-201ENST00000306732 KIF21BO75037 1637 aa29.48■■■□□ 2.31
PITX2-201ENST00000306732 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
PITX2-201ENST00000306732 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
PITX2-201ENST00000306732 CLIP1P30622 1438 aa29.43■■■□□ 2.3
PITX2-201ENST00000306732 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
PITX2-201ENST00000306732 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.36■■■□□ 2.29
PITX2-201ENST00000306732 MIER1Q8N108 512 aa29.32■■■□□ 2.28
PITX2-201ENST00000306732 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.29■■■□□ 2.28
PITX2-201ENST00000306732 APLP2Q06481 763 aa29.19■■■□□ 2.26
PITX2-201ENST00000306732 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
PITX2-201ENST00000306732 HMGXB3Q12766 1538 aa29.07■■■□□ 2.24
PITX2-201ENST00000306732 NCAPD3P42695 1498 aa29.06■■■□□ 2.24
PITX2-201ENST00000306732 TOP2BQ02880 1626 aa29.05■■■□□ 2.24
PITX2-201ENST00000306732 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29■■■□□ 2.23
PITX2-201ENST00000306732 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.95■■■□□ 2.22
PITX2-201ENST00000306732 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PITX2-201ENST00000306732 ARAP1Q96P48 1450 aa28.93■■■□□ 2.22
PITX2-201ENST00000306732 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.91■■■□□ 2.22
PITX2-201ENST00000306732 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.91■■■□□ 2.22
PITX2-201ENST00000306732 PRXQ9BXM0 1461 aa28.9■■■□□ 2.22
PITX2-201ENST00000306732 MYT1Q01538 1121 aa28.88■■■□□ 2.21
PITX2-201ENST00000306732 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
PITX2-201ENST00000306732 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.82■■■□□ 2.2
PITX2-201ENST00000306732 CFTRP13569 1480 aa28.77■■■□□ 2.2
PITX2-201ENST00000306732 CUX1P39880 1505 aa28.75■■■□□ 2.19
PITX2-201ENST00000306732 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
PITX2-201ENST00000306732 CUX2O14529 1486 aa28.65■■■□□ 2.18
PITX2-201ENST00000306732 KIF27Q86VH2 1401 aa28.63■■■□□ 2.17
PITX2-201ENST00000306732 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.6■■■□□ 2.17
PITX2-201ENST00000306732 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.59■■■□□ 2.17
PITX2-201ENST00000306732 SLC24A1O60721 1099 aa28.58■■■□□ 2.17
PITX2-201ENST00000306732 PRDM2Q13029 1718 aa28.56■■■□□ 2.16
PITX2-201ENST00000306732 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
PITX2-201ENST00000306732 ITGAEP38570 1179 aa28.51■■■□□ 2.15
PITX2-201ENST00000306732 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.44■■■□□ 2.14
PITX2-201ENST00000306732 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.43■■■□□ 2.14
PITX2-201ENST00000306732 MAPKBP1O60336 1514 aa28.42■■■□□ 2.14
PITX2-201ENST00000306732 TIAM1Q13009 1591 aa28.36■■■□□ 2.13
PITX2-201ENST00000306732 KCNH8Q96L42 1107 aa28.34■■■□□ 2.13
PITX2-201ENST00000306732 IGF1RP08069 1367 aa28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.6 ms