Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL6Q02878 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL6Q02878 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms