Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX1P22670 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX1P22670 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX1P22670 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX1P22670 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX1P22670 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX1P22670 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX1P22670 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX1P22670 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX1P22670 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX1P22670 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX1P22670 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX1P22670 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX1P22670 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX1P22670 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX1P22670 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX1P22670 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX1P22670 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX1P22670 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX1P22670 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX1P22670 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX1P22670 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX1P22670 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX1P22670 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX1P22670 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX1P22670 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX1P22670 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX1P22670 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX1P22670 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX1P22670 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX1P22670 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX1P22670 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX1P22670 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX1P22670 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX1P22670 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX1P22670 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX1P22670 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX1P22670 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX1P22670 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX1P22670 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX1P22670 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX1P22670 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX1P22670 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX1P22670 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX1P22670 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX1P22670 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX1P22670 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX1P22670 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX1P22670 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX1P22670 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX1P22670 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX1P22670 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX1P22670 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX1P22670 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX1P22670 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX1P22670 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX1P22670 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX1P22670 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX1P22670 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX1P22670 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX1P22670 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX1P22670 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX1P22670 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX1P22670 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX1P22670 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX1P22670 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX1P22670 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX1P22670 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX1P22670 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX1P22670 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX1P22670 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX1P22670 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX1P22670 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX1P22670 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX1P22670 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX1P22670 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX1P22670 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX1P22670 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX1P22670 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX1P22670 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX1P22670 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX1P22670 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX1P22670 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX1P22670 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX1P22670 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX1P22670 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX1P22670 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX1P22670 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX1P22670 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX1P22670 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX1P22670 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX1P22670 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX1P22670 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX1P22670 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX1P22670 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX1P22670 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX1P22670 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX1P22670 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX1P22670 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX1P22670 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms