Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S2

CDC42BPB, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPBQ9Y5S2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
CDC42BPBQ9Y5S2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
CDC42BPBQ9Y5S2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
CDC42BPBQ9Y5S2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CDC42BPBQ9Y5S2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CDC42BPBQ9Y5S2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
CDC42BPBQ9Y5S2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
CDC42BPBQ9Y5S2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC43.3■■■■■ 4.52
CDC42BPBQ9Y5S2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
CDC42BPBQ9Y5S2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
CDC42BPBQ9Y5S2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
CDC42BPBQ9Y5S2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
CDC42BPBQ9Y5S2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.5
CDC42BPBQ9Y5S2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CDC42BPBQ9Y5S2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CDC42BPBQ9Y5S2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
CDC42BPBQ9Y5S2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
CDC42BPBQ9Y5S2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
CDC42BPBQ9Y5S2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CDC42BPBQ9Y5S2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CDC42BPBQ9Y5S2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
CDC42BPBQ9Y5S2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
CDC42BPBQ9Y5S2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CDC42BPBQ9Y5S2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
CDC42BPBQ9Y5S2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CDC42BPBQ9Y5S2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
CDC42BPBQ9Y5S2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
CDC42BPBQ9Y5S2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
CDC42BPBQ9Y5S2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.98■■■■■ 4.47
CDC42BPBQ9Y5S2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
CDC42BPBQ9Y5S2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CDC42BPBQ9Y5S2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CDC42BPBQ9Y5S2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
CDC42BPBQ9Y5S2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CDC42BPBQ9Y5S2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
CDC42BPBQ9Y5S2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
CDC42BPBQ9Y5S2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CDC42BPBQ9Y5S2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CDC42BPBQ9Y5S2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CDC42BPBQ9Y5S2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
CDC42BPBQ9Y5S2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
CDC42BPBQ9Y5S2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CDC42BPBQ9Y5S2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CDC42BPBQ9Y5S2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CDC42BPBQ9Y5S2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
CDC42BPBQ9Y5S2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
CDC42BPBQ9Y5S2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
CDC42BPBQ9Y5S2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
CDC42BPBQ9Y5S2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
CDC42BPBQ9Y5S2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
CDC42BPBQ9Y5S2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CDC42BPBQ9Y5S2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CDC42BPBQ9Y5S2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CDC42BPBQ9Y5S2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CDC42BPBQ9Y5S2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.77■■■■■ 4.44
CDC42BPBQ9Y5S2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
CDC42BPBQ9Y5S2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.43
CDC42BPBQ9Y5S2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CDC42BPBQ9Y5S2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
CDC42BPBQ9Y5S2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
CDC42BPBQ9Y5S2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
CDC42BPBQ9Y5S2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
CDC42BPBQ9Y5S2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CDC42BPBQ9Y5S2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
CDC42BPBQ9Y5S2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CDC42BPBQ9Y5S2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CDC42BPBQ9Y5S2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CDC42BPBQ9Y5S2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CDC42BPBQ9Y5S2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CDC42BPBQ9Y5S2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
CDC42BPBQ9Y5S2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CDC42BPBQ9Y5S2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
CDC42BPBQ9Y5S2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
CDC42BPBQ9Y5S2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CDC42BPBQ9Y5S2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CDC42BPBQ9Y5S2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CDC42BPBQ9Y5S2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.54■■■■■ 4.4
CDC42BPBQ9Y5S2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
CDC42BPBQ9Y5S2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
CDC42BPBQ9Y5S2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.51■■■■■ 4.4
CDC42BPBQ9Y5S2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CDC42BPBQ9Y5S2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CDC42BPBQ9Y5S2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
CDC42BPBQ9Y5S2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CDC42BPBQ9Y5S2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
CDC42BPBQ9Y5S2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CDC42BPBQ9Y5S2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CDC42BPBQ9Y5S2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CDC42BPBQ9Y5S2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CDC42BPBQ9Y5S2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CDC42BPBQ9Y5S2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CDC42BPBQ9Y5S2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
CDC42BPBQ9Y5S2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CDC42BPBQ9Y5S2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
CDC42BPBQ9Y5S2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.36
CDC42BPBQ9Y5S2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CDC42BPBQ9Y5S2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CDC42BPBQ9Y5S2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms