Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRC42Q9Y546 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC42Q9Y546 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC42Q9Y546 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC42Q9Y546 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC42Q9Y546 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC42Q9Y546 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC42Q9Y546 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC42Q9Y546 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC42Q9Y546 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC42Q9Y546 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC42Q9Y546 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC42Q9Y546 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC42Q9Y546 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC42Q9Y546 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC42Q9Y546 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC42Q9Y546 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC42Q9Y546 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC42Q9Y546 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC42Q9Y546 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC42Q9Y546 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC42Q9Y546 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC42Q9Y546 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LRRC42Q9Y546 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC42Q9Y546 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC42Q9Y546 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC42Q9Y546 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC42Q9Y546 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC42Q9Y546 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC42Q9Y546 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC42Q9Y546 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC42Q9Y546 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC42Q9Y546 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC42Q9Y546 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC42Q9Y546 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC42Q9Y546 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC42Q9Y546 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC42Q9Y546 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC42Q9Y546 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC42Q9Y546 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC42Q9Y546 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC42Q9Y546 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC42Q9Y546 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC42Q9Y546 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC42Q9Y546 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC42Q9Y546 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRRC42Q9Y546 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC42Q9Y546 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC42Q9Y546 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC42Q9Y546 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC42Q9Y546 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC42Q9Y546 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC42Q9Y546 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC42Q9Y546 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC42Q9Y546 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC42Q9Y546 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC42Q9Y546 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC42Q9Y546 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC42Q9Y546 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC42Q9Y546 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC42Q9Y546 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC42Q9Y546 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC42Q9Y546 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC42Q9Y546 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC42Q9Y546 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC42Q9Y546 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC42Q9Y546 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC42Q9Y546 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC42Q9Y546 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC42Q9Y546 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC42Q9Y546 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRC42Q9Y546 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC42Q9Y546 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC42Q9Y546 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC42Q9Y546 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC42Q9Y546 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC42Q9Y546 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC42Q9Y546 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC42Q9Y546 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC42Q9Y546 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC42Q9Y546 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC42Q9Y546 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC42Q9Y546 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC42Q9Y546 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC42Q9Y546 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC42Q9Y546 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC42Q9Y546 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC42Q9Y546 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC42Q9Y546 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC42Q9Y546 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC42Q9Y546 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC42Q9Y546 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC42Q9Y546 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRC42Q9Y546 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC42Q9Y546 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC42Q9Y546 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC42Q9Y546 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC42Q9Y546 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC42Q9Y546 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC42Q9Y546 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms