Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
RAPGEF2Q9Y4G8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC46.29■■■■■ 5
RAPGEF2Q9Y4G8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
RAPGEF2Q9Y4G8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
RAPGEF2Q9Y4G8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
RAPGEF2Q9Y4G8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
RAPGEF2Q9Y4G8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
RAPGEF2Q9Y4G8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC46.24■■■■■ 4.99
RAPGEF2Q9Y4G8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
RAPGEF2Q9Y4G8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC46.21■■■■■ 4.99
RAPGEF2Q9Y4G8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
RAPGEF2Q9Y4G8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
RAPGEF2Q9Y4G8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
RAPGEF2Q9Y4G8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
RAPGEF2Q9Y4G8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC46.1■■■■■ 4.97
RAPGEF2Q9Y4G8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC46.09■■■■■ 4.97
RAPGEF2Q9Y4G8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
RAPGEF2Q9Y4G8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
RAPGEF2Q9Y4G8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
RAPGEF2Q9Y4G8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.06■■■■■ 4.96
RAPGEF2Q9Y4G8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.04■■■■■ 4.96
RAPGEF2Q9Y4G8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC46.04■■■■■ 4.96
RAPGEF2Q9Y4G8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
RAPGEF2Q9Y4G8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC46.02■■■■■ 4.96
RAPGEF2Q9Y4G8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC46.01■■■■■ 4.96
RAPGEF2Q9Y4G8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
RAPGEF2Q9Y4G8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
RAPGEF2Q9Y4G8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.96■■■■■ 4.95
RAPGEF2Q9Y4G8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC45.96■■■■■ 4.95
RAPGEF2Q9Y4G8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
RAPGEF2Q9Y4G8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
RAPGEF2Q9Y4G8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC45.91■■■■■ 4.94
RAPGEF2Q9Y4G8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
RAPGEF2Q9Y4G8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
RAPGEF2Q9Y4G8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
RAPGEF2Q9Y4G8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC45.85■■■■■ 4.93
RAPGEF2Q9Y4G8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.85■■■■■ 4.93
RAPGEF2Q9Y4G8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC45.82■■■■■ 4.93
RAPGEF2Q9Y4G8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC45.82■■■■■ 4.93
RAPGEF2Q9Y4G8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
RAPGEF2Q9Y4G8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC45.78■■■■■ 4.92
RAPGEF2Q9Y4G8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
RAPGEF2Q9Y4G8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC45.75■■■■■ 4.91
RAPGEF2Q9Y4G8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
RAPGEF2Q9Y4G8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
RAPGEF2Q9Y4G8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
RAPGEF2Q9Y4G8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
RAPGEF2Q9Y4G8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
RAPGEF2Q9Y4G8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.66■■■■■ 4.9
RAPGEF2Q9Y4G8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC45.65■■■■■ 4.9
RAPGEF2Q9Y4G8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
RAPGEF2Q9Y4G8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
RAPGEF2Q9Y4G8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
RAPGEF2Q9Y4G8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.6■■■■■ 4.89
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
RAPGEF2Q9Y4G8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
RAPGEF2Q9Y4G8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC45.56■■■■■ 4.88
RAPGEF2Q9Y4G8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
RAPGEF2Q9Y4G8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC45.55■■■■■ 4.88
RAPGEF2Q9Y4G8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC45.53■■■■■ 4.88
RAPGEF2Q9Y4G8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
RAPGEF2Q9Y4G8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
RAPGEF2Q9Y4G8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC45.51■■■■■ 4.88
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
RAPGEF2Q9Y4G8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
RAPGEF2Q9Y4G8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC45.47■■■■■ 4.87
RAPGEF2Q9Y4G8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.87
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
RAPGEF2Q9Y4G8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC45.39■■■■■ 4.86
RAPGEF2Q9Y4G8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
RAPGEF2Q9Y4G8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
RAPGEF2Q9Y4G8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
RAPGEF2Q9Y4G8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
RAPGEF2Q9Y4G8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
RAPGEF2Q9Y4G8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC45.32■■■■■ 4.85
RAPGEF2Q9Y4G8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
RAPGEF2Q9Y4G8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
RAPGEF2Q9Y4G8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
RAPGEF2Q9Y4G8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
RAPGEF2Q9Y4G8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
RAPGEF2Q9Y4G8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
RAPGEF2Q9Y4G8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
RAPGEF2Q9Y4G8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
RAPGEF2Q9Y4G8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
RAPGEF2Q9Y4G8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
RAPGEF2Q9Y4G8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
RAPGEF2Q9Y4G8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC45.18■■■■■ 4.82
RAPGEF2Q9Y4G8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
RAPGEF2Q9Y4G8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
RAPGEF2Q9Y4G8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
RAPGEF2Q9Y4G8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
RAPGEF2Q9Y4G8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
RAPGEF2Q9Y4G8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC45.16■■■■■ 4.82
RAPGEF2Q9Y4G8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
RAPGEF2Q9Y4G8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
RAPGEF2Q9Y4G8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
RAPGEF2Q9Y4G8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC45.14■■■■■ 4.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms