Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ZNF330Q9Y3S2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
ZNF330Q9Y3S2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ZNF330Q9Y3S2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
ZNF330Q9Y3S2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF330Q9Y3S2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF330Q9Y3S2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF330Q9Y3S2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ZNF330Q9Y3S2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZNF330Q9Y3S2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZNF330Q9Y3S2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZNF330Q9Y3S2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ZNF330Q9Y3S2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ZNF330Q9Y3S2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
ZNF330Q9Y3S2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZNF330Q9Y3S2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ZNF330Q9Y3S2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
ZNF330Q9Y3S2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ZNF330Q9Y3S2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ZNF330Q9Y3S2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ZNF330Q9Y3S2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ZNF330Q9Y3S2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ZNF330Q9Y3S2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ZNF330Q9Y3S2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZNF330Q9Y3S2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZNF330Q9Y3S2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZNF330Q9Y3S2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ZNF330Q9Y3S2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ZNF330Q9Y3S2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ZNF330Q9Y3S2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF330Q9Y3S2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF330Q9Y3S2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF330Q9Y3S2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ZNF330Q9Y3S2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZNF330Q9Y3S2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZNF330Q9Y3S2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZNF330Q9Y3S2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZNF330Q9Y3S2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZNF330Q9Y3S2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ZNF330Q9Y3S2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZNF330Q9Y3S2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ZNF330Q9Y3S2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ZNF330Q9Y3S2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ZNF330Q9Y3S2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF330Q9Y3S2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF330Q9Y3S2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF330Q9Y3S2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF330Q9Y3S2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ZNF330Q9Y3S2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF330Q9Y3S2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ZNF330Q9Y3S2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF330Q9Y3S2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF330Q9Y3S2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZNF330Q9Y3S2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ZNF330Q9Y3S2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ZNF330Q9Y3S2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ZNF330Q9Y3S2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ZNF330Q9Y3S2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF330Q9Y3S2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF330Q9Y3S2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ZNF330Q9Y3S2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
ZNF330Q9Y3S2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ZNF330Q9Y3S2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
ZNF330Q9Y3S2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ZNF330Q9Y3S2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZNF330Q9Y3S2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZNF330Q9Y3S2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
ZNF330Q9Y3S2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ZNF330Q9Y3S2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
ZNF330Q9Y3S2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ZNF330Q9Y3S2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZNF330Q9Y3S2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZNF330Q9Y3S2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZNF330Q9Y3S2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
ZNF330Q9Y3S2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ZNF330Q9Y3S2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF330Q9Y3S2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ZNF330Q9Y3S2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ZNF330Q9Y3S2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF330Q9Y3S2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF330Q9Y3S2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF330Q9Y3S2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF330Q9Y3S2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ZNF330Q9Y3S2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF330Q9Y3S2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF330Q9Y3S2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF330Q9Y3S2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZNF330Q9Y3S2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ZNF330Q9Y3S2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ZNF330Q9Y3S2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
ZNF330Q9Y3S2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ZNF330Q9Y3S2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ZNF330Q9Y3S2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
ZNF330Q9Y3S2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
ZNF330Q9Y3S2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ZNF330Q9Y3S2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ZNF330Q9Y3S2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ZNF330Q9Y3S2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZNF330Q9Y3S2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms