Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KCNH4Q9UQ05 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KCNH4Q9UQ05 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KCNH4Q9UQ05 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KCNH4Q9UQ05 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KCNH4Q9UQ05 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KCNH4Q9UQ05 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KCNH4Q9UQ05 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KCNH4Q9UQ05 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KCNH4Q9UQ05 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
KCNH4Q9UQ05 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KCNH4Q9UQ05 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
KCNH4Q9UQ05 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
KCNH4Q9UQ05 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KCNH4Q9UQ05 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KCNH4Q9UQ05 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KCNH4Q9UQ05 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KCNH4Q9UQ05 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KCNH4Q9UQ05 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KCNH4Q9UQ05 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KCNH4Q9UQ05 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KCNH4Q9UQ05 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
KCNH4Q9UQ05 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
KCNH4Q9UQ05 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KCNH4Q9UQ05 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KCNH4Q9UQ05 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
KCNH4Q9UQ05 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KCNH4Q9UQ05 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KCNH4Q9UQ05 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KCNH4Q9UQ05 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KCNH4Q9UQ05 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KCNH4Q9UQ05 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KCNH4Q9UQ05 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KCNH4Q9UQ05 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
KCNH4Q9UQ05 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KCNH4Q9UQ05 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
KCNH4Q9UQ05 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KCNH4Q9UQ05 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KCNH4Q9UQ05 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
KCNH4Q9UQ05 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KCNH4Q9UQ05 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KCNH4Q9UQ05 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KCNH4Q9UQ05 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
KCNH4Q9UQ05 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KCNH4Q9UQ05 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KCNH4Q9UQ05 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KCNH4Q9UQ05 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KCNH4Q9UQ05 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KCNH4Q9UQ05 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KCNH4Q9UQ05 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
KCNH4Q9UQ05 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
KCNH4Q9UQ05 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KCNH4Q9UQ05 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
KCNH4Q9UQ05 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KCNH4Q9UQ05 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
KCNH4Q9UQ05 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KCNH4Q9UQ05 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KCNH4Q9UQ05 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KCNH4Q9UQ05 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KCNH4Q9UQ05 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KCNH4Q9UQ05 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KCNH4Q9UQ05 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KCNH4Q9UQ05 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KCNH4Q9UQ05 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KCNH4Q9UQ05 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
KCNH4Q9UQ05 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KCNH4Q9UQ05 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KCNH4Q9UQ05 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
KCNH4Q9UQ05 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KCNH4Q9UQ05 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KCNH4Q9UQ05 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KCNH4Q9UQ05 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KCNH4Q9UQ05 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KCNH4Q9UQ05 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KCNH4Q9UQ05 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KCNH4Q9UQ05 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KCNH4Q9UQ05 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KCNH4Q9UQ05 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KCNH4Q9UQ05 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KCNH4Q9UQ05 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KCNH4Q9UQ05 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KCNH4Q9UQ05 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KCNH4Q9UQ05 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KCNH4Q9UQ05 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KCNH4Q9UQ05 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KCNH4Q9UQ05 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KCNH4Q9UQ05 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KCNH4Q9UQ05 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KCNH4Q9UQ05 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KCNH4Q9UQ05 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KCNH4Q9UQ05 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KCNH4Q9UQ05 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KCNH4Q9UQ05 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KCNH4Q9UQ05 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
KCNH4Q9UQ05 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KCNH4Q9UQ05 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
KCNH4Q9UQ05 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KCNH4Q9UQ05 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KCNH4Q9UQ05 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KCNH4Q9UQ05 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms