Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT8

HECTD1, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1, humanhuman

Predictions only

Length 2,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD1Q9ULT8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECTD1Q9ULT8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HECTD1Q9ULT8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HECTD1Q9ULT8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HECTD1Q9ULT8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HECTD1Q9ULT8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECTD1Q9ULT8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECTD1Q9ULT8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECTD1Q9ULT8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECTD1Q9ULT8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HECTD1Q9ULT8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECTD1Q9ULT8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECTD1Q9ULT8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECTD1Q9ULT8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECTD1Q9ULT8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECTD1Q9ULT8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECTD1Q9ULT8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECTD1Q9ULT8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECTD1Q9ULT8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECTD1Q9ULT8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECTD1Q9ULT8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECTD1Q9ULT8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECTD1Q9ULT8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HECTD1Q9ULT8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECTD1Q9ULT8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HECTD1Q9ULT8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HECTD1Q9ULT8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HECTD1Q9ULT8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HECTD1Q9ULT8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECTD1Q9ULT8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HECTD1Q9ULT8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HECTD1Q9ULT8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HECTD1Q9ULT8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HECTD1Q9ULT8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HECTD1Q9ULT8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HECTD1Q9ULT8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HECTD1Q9ULT8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HECTD1Q9ULT8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECTD1Q9ULT8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECTD1Q9ULT8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECTD1Q9ULT8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECTD1Q9ULT8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECTD1Q9ULT8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HECTD1Q9ULT8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HECTD1Q9ULT8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECTD1Q9ULT8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECTD1Q9ULT8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HECTD1Q9ULT8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECTD1Q9ULT8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECTD1Q9ULT8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HECTD1Q9ULT8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECTD1Q9ULT8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HECTD1Q9ULT8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HECTD1Q9ULT8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECTD1Q9ULT8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECTD1Q9ULT8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECTD1Q9ULT8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECTD1Q9ULT8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECTD1Q9ULT8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECTD1Q9ULT8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECTD1Q9ULT8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECTD1Q9ULT8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECTD1Q9ULT8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECTD1Q9ULT8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HECTD1Q9ULT8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECTD1Q9ULT8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECTD1Q9ULT8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECTD1Q9ULT8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HECTD1Q9ULT8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HECTD1Q9ULT8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HECTD1Q9ULT8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HECTD1Q9ULT8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HECTD1Q9ULT8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HECTD1Q9ULT8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HECTD1Q9ULT8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HECTD1Q9ULT8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HECTD1Q9ULT8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HECTD1Q9ULT8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HECTD1Q9ULT8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HECTD1Q9ULT8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HECTD1Q9ULT8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECTD1Q9ULT8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HECTD1Q9ULT8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HECTD1Q9ULT8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HECTD1Q9ULT8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HECTD1Q9ULT8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HECTD1Q9ULT8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HECTD1Q9ULT8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HECTD1Q9ULT8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HECTD1Q9ULT8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HECTD1Q9ULT8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECTD1Q9ULT8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HECTD1Q9ULT8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HECTD1Q9ULT8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECTD1Q9ULT8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HECTD1Q9ULT8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECTD1Q9ULT8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HECTD1Q9ULT8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECTD1Q9ULT8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HECTD1Q9ULT8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms