Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBD1Q9UJT1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBD1Q9UJT1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBD1Q9UJT1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBD1Q9UJT1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBD1Q9UJT1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBD1Q9UJT1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBD1Q9UJT1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBD1Q9UJT1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBD1Q9UJT1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBD1Q9UJT1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBD1Q9UJT1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBD1Q9UJT1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBD1Q9UJT1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBD1Q9UJT1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBD1Q9UJT1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBD1Q9UJT1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBD1Q9UJT1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBD1Q9UJT1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBD1Q9UJT1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBD1Q9UJT1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBD1Q9UJT1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBD1Q9UJT1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBD1Q9UJT1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBD1Q9UJT1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBD1Q9UJT1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBD1Q9UJT1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBD1Q9UJT1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBD1Q9UJT1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBD1Q9UJT1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBD1Q9UJT1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBD1Q9UJT1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBD1Q9UJT1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBD1Q9UJT1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBD1Q9UJT1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBD1Q9UJT1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBD1Q9UJT1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBD1Q9UJT1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBD1Q9UJT1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBD1Q9UJT1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBD1Q9UJT1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBD1Q9UJT1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBD1Q9UJT1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBD1Q9UJT1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBD1Q9UJT1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBD1Q9UJT1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBD1Q9UJT1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBD1Q9UJT1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBD1Q9UJT1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBD1Q9UJT1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBD1Q9UJT1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBD1Q9UJT1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBD1Q9UJT1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBD1Q9UJT1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBD1Q9UJT1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBD1Q9UJT1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBD1Q9UJT1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBD1Q9UJT1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBD1Q9UJT1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBD1Q9UJT1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBD1Q9UJT1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBD1Q9UJT1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBD1Q9UJT1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBD1Q9UJT1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBD1Q9UJT1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBD1Q9UJT1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBD1Q9UJT1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBD1Q9UJT1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBD1Q9UJT1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBD1Q9UJT1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBD1Q9UJT1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBD1Q9UJT1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBD1Q9UJT1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBD1Q9UJT1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBD1Q9UJT1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBD1Q9UJT1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBD1Q9UJT1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBD1Q9UJT1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBD1Q9UJT1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBD1Q9UJT1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBD1Q9UJT1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBD1Q9UJT1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBD1Q9UJT1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBD1Q9UJT1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBD1Q9UJT1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBD1Q9UJT1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBD1Q9UJT1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBD1Q9UJT1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBD1Q9UJT1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBD1Q9UJT1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBD1Q9UJT1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBD1Q9UJT1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBD1Q9UJT1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBD1Q9UJT1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBD1Q9UJT1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBD1Q9UJT1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBD1Q9UJT1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBD1Q9UJT1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBD1Q9UJT1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBD1Q9UJT1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms