Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SS18L2Q9UHA2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SS18L2Q9UHA2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SS18L2Q9UHA2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SS18L2Q9UHA2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SS18L2Q9UHA2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SS18L2Q9UHA2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SS18L2Q9UHA2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SS18L2Q9UHA2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SS18L2Q9UHA2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SS18L2Q9UHA2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SS18L2Q9UHA2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SS18L2Q9UHA2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SS18L2Q9UHA2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SS18L2Q9UHA2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SS18L2Q9UHA2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SS18L2Q9UHA2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SS18L2Q9UHA2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SS18L2Q9UHA2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SS18L2Q9UHA2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SS18L2Q9UHA2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SS18L2Q9UHA2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SS18L2Q9UHA2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SS18L2Q9UHA2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SS18L2Q9UHA2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SS18L2Q9UHA2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SS18L2Q9UHA2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SS18L2Q9UHA2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SS18L2Q9UHA2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SS18L2Q9UHA2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SS18L2Q9UHA2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SS18L2Q9UHA2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SS18L2Q9UHA2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SS18L2Q9UHA2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SS18L2Q9UHA2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SS18L2Q9UHA2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SS18L2Q9UHA2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SS18L2Q9UHA2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SS18L2Q9UHA2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SS18L2Q9UHA2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SS18L2Q9UHA2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SS18L2Q9UHA2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SS18L2Q9UHA2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SS18L2Q9UHA2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SS18L2Q9UHA2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SS18L2Q9UHA2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SS18L2Q9UHA2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SS18L2Q9UHA2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SS18L2Q9UHA2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SS18L2Q9UHA2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SS18L2Q9UHA2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SS18L2Q9UHA2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SS18L2Q9UHA2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SS18L2Q9UHA2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SS18L2Q9UHA2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SS18L2Q9UHA2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SS18L2Q9UHA2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SS18L2Q9UHA2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SS18L2Q9UHA2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SS18L2Q9UHA2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SS18L2Q9UHA2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SS18L2Q9UHA2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SS18L2Q9UHA2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SS18L2Q9UHA2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SS18L2Q9UHA2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SS18L2Q9UHA2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SS18L2Q9UHA2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SS18L2Q9UHA2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SS18L2Q9UHA2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SS18L2Q9UHA2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SS18L2Q9UHA2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SS18L2Q9UHA2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SS18L2Q9UHA2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SS18L2Q9UHA2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SS18L2Q9UHA2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SS18L2Q9UHA2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SS18L2Q9UHA2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SS18L2Q9UHA2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SS18L2Q9UHA2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SS18L2Q9UHA2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms