Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VTI1BQ9UEU0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VTI1BQ9UEU0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VTI1BQ9UEU0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VTI1BQ9UEU0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VTI1BQ9UEU0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VTI1BQ9UEU0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VTI1BQ9UEU0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VTI1BQ9UEU0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VTI1BQ9UEU0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VTI1BQ9UEU0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VTI1BQ9UEU0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VTI1BQ9UEU0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VTI1BQ9UEU0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VTI1BQ9UEU0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VTI1BQ9UEU0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VTI1BQ9UEU0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VTI1BQ9UEU0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VTI1BQ9UEU0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VTI1BQ9UEU0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VTI1BQ9UEU0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VTI1BQ9UEU0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VTI1BQ9UEU0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VTI1BQ9UEU0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VTI1BQ9UEU0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VTI1BQ9UEU0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VTI1BQ9UEU0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VTI1BQ9UEU0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VTI1BQ9UEU0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VTI1BQ9UEU0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VTI1BQ9UEU0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VTI1BQ9UEU0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTI1BQ9UEU0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTI1BQ9UEU0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VTI1BQ9UEU0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VTI1BQ9UEU0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VTI1BQ9UEU0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VTI1BQ9UEU0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VTI1BQ9UEU0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VTI1BQ9UEU0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VTI1BQ9UEU0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VTI1BQ9UEU0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VTI1BQ9UEU0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VTI1BQ9UEU0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
VTI1BQ9UEU0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VTI1BQ9UEU0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VTI1BQ9UEU0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VTI1BQ9UEU0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VTI1BQ9UEU0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VTI1BQ9UEU0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VTI1BQ9UEU0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VTI1BQ9UEU0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VTI1BQ9UEU0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VTI1BQ9UEU0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VTI1BQ9UEU0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VTI1BQ9UEU0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VTI1BQ9UEU0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VTI1BQ9UEU0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VTI1BQ9UEU0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VTI1BQ9UEU0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VTI1BQ9UEU0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VTI1BQ9UEU0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VTI1BQ9UEU0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VTI1BQ9UEU0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VTI1BQ9UEU0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VTI1BQ9UEU0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VTI1BQ9UEU0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VTI1BQ9UEU0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VTI1BQ9UEU0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VTI1BQ9UEU0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VTI1BQ9UEU0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VTI1BQ9UEU0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
VTI1BQ9UEU0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VTI1BQ9UEU0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VTI1BQ9UEU0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VTI1BQ9UEU0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VTI1BQ9UEU0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VTI1BQ9UEU0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VTI1BQ9UEU0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VTI1BQ9UEU0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VTI1BQ9UEU0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VTI1BQ9UEU0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VTI1BQ9UEU0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VTI1BQ9UEU0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VTI1BQ9UEU0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VTI1BQ9UEU0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VTI1BQ9UEU0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VTI1BQ9UEU0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VTI1BQ9UEU0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VTI1BQ9UEU0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VTI1BQ9UEU0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VTI1BQ9UEU0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VTI1BQ9UEU0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VTI1BQ9UEU0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VTI1BQ9UEU0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VTI1BQ9UEU0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VTI1BQ9UEU0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VTI1BQ9UEU0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VTI1BQ9UEU0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VTI1BQ9UEU0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms