Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TULP4Q9NRJ4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TULP4Q9NRJ4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
TULP4Q9NRJ4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
TULP4Q9NRJ4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
TULP4Q9NRJ4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
TULP4Q9NRJ4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
TULP4Q9NRJ4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
TULP4Q9NRJ4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
TULP4Q9NRJ4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
TULP4Q9NRJ4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TULP4Q9NRJ4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TULP4Q9NRJ4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TULP4Q9NRJ4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TULP4Q9NRJ4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
TULP4Q9NRJ4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TULP4Q9NRJ4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TULP4Q9NRJ4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TULP4Q9NRJ4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TULP4Q9NRJ4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TULP4Q9NRJ4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TULP4Q9NRJ4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
TULP4Q9NRJ4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
TULP4Q9NRJ4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TULP4Q9NRJ4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
TULP4Q9NRJ4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TULP4Q9NRJ4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TULP4Q9NRJ4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
TULP4Q9NRJ4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
TULP4Q9NRJ4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
TULP4Q9NRJ4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TULP4Q9NRJ4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
TULP4Q9NRJ4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
TULP4Q9NRJ4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TULP4Q9NRJ4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TULP4Q9NRJ4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TULP4Q9NRJ4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TULP4Q9NRJ4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
TULP4Q9NRJ4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
TULP4Q9NRJ4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TULP4Q9NRJ4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TULP4Q9NRJ4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TULP4Q9NRJ4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
TULP4Q9NRJ4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.81
TULP4Q9NRJ4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.82■■■■□ 3.8
TULP4Q9NRJ4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
TULP4Q9NRJ4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
TULP4Q9NRJ4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
TULP4Q9NRJ4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
TULP4Q9NRJ4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
TULP4Q9NRJ4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TULP4Q9NRJ4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TULP4Q9NRJ4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
TULP4Q9NRJ4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TULP4Q9NRJ4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TULP4Q9NRJ4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TULP4Q9NRJ4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TULP4Q9NRJ4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TULP4Q9NRJ4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TULP4Q9NRJ4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TULP4Q9NRJ4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TULP4Q9NRJ4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
TULP4Q9NRJ4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
TULP4Q9NRJ4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
TULP4Q9NRJ4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
TULP4Q9NRJ4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
TULP4Q9NRJ4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TULP4Q9NRJ4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
TULP4Q9NRJ4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TULP4Q9NRJ4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TULP4Q9NRJ4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
TULP4Q9NRJ4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TULP4Q9NRJ4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
TULP4Q9NRJ4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TULP4Q9NRJ4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
TULP4Q9NRJ4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
TULP4Q9NRJ4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TULP4Q9NRJ4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TULP4Q9NRJ4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
TULP4Q9NRJ4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TULP4Q9NRJ4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TULP4Q9NRJ4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TULP4Q9NRJ4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TULP4Q9NRJ4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TULP4Q9NRJ4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TULP4Q9NRJ4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
TULP4Q9NRJ4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TULP4Q9NRJ4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TULP4Q9NRJ4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
TULP4Q9NRJ4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
TULP4Q9NRJ4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TULP4Q9NRJ4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TULP4Q9NRJ4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TULP4Q9NRJ4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TULP4Q9NRJ4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TULP4Q9NRJ4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TULP4Q9NRJ4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TULP4Q9NRJ4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TULP4Q9NRJ4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TULP4Q9NRJ4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms