Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9H4

VPS37B, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37BQ9H9H4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VPS37BQ9H9H4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS37BQ9H9H4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS37BQ9H9H4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS37BQ9H9H4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS37BQ9H9H4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS37BQ9H9H4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS37BQ9H9H4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS37BQ9H9H4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS37BQ9H9H4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS37BQ9H9H4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS37BQ9H9H4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS37BQ9H9H4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS37BQ9H9H4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS37BQ9H9H4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS37BQ9H9H4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS37BQ9H9H4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS37BQ9H9H4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS37BQ9H9H4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS37BQ9H9H4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS37BQ9H9H4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS37BQ9H9H4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS37BQ9H9H4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS37BQ9H9H4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS37BQ9H9H4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS37BQ9H9H4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS37BQ9H9H4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS37BQ9H9H4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS37BQ9H9H4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS37BQ9H9H4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS37BQ9H9H4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS37BQ9H9H4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS37BQ9H9H4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS37BQ9H9H4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS37BQ9H9H4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS37BQ9H9H4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VPS37BQ9H9H4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VPS37BQ9H9H4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS37BQ9H9H4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS37BQ9H9H4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS37BQ9H9H4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS37BQ9H9H4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS37BQ9H9H4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS37BQ9H9H4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS37BQ9H9H4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS37BQ9H9H4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS37BQ9H9H4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS37BQ9H9H4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS37BQ9H9H4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS37BQ9H9H4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37BQ9H9H4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37BQ9H9H4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37BQ9H9H4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37BQ9H9H4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS37BQ9H9H4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS37BQ9H9H4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS37BQ9H9H4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS37BQ9H9H4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS37BQ9H9H4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS37BQ9H9H4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37BQ9H9H4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS37BQ9H9H4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS37BQ9H9H4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS37BQ9H9H4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS37BQ9H9H4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS37BQ9H9H4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS37BQ9H9H4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS37BQ9H9H4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS37BQ9H9H4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS37BQ9H9H4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS37BQ9H9H4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS37BQ9H9H4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS37BQ9H9H4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VPS37BQ9H9H4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS37BQ9H9H4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37BQ9H9H4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37BQ9H9H4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37BQ9H9H4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37BQ9H9H4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS37BQ9H9H4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37BQ9H9H4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37BQ9H9H4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS37BQ9H9H4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS37BQ9H9H4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS37BQ9H9H4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS37BQ9H9H4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VPS37BQ9H9H4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS37BQ9H9H4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS37BQ9H9H4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS37BQ9H9H4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS37BQ9H9H4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS37BQ9H9H4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS37BQ9H9H4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS37BQ9H9H4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37BQ9H9H4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37BQ9H9H4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37BQ9H9H4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37BQ9H9H4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS37BQ9H9H4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS37BQ9H9H4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms