Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTD2Q9H8S5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTD2Q9H8S5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTD2Q9H8S5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTD2Q9H8S5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTD2Q9H8S5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTD2Q9H8S5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTD2Q9H8S5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTD2Q9H8S5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTD2Q9H8S5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTD2Q9H8S5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTD2Q9H8S5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTD2Q9H8S5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTD2Q9H8S5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTD2Q9H8S5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTD2Q9H8S5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTD2Q9H8S5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTD2Q9H8S5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTD2Q9H8S5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTD2Q9H8S5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTD2Q9H8S5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTD2Q9H8S5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTD2Q9H8S5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTD2Q9H8S5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTD2Q9H8S5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTD2Q9H8S5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTD2Q9H8S5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTD2Q9H8S5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTD2Q9H8S5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms