Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTD2Q9H8S5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTD2Q9H8S5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTD2Q9H8S5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTD2Q9H8S5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTD2Q9H8S5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTD2Q9H8S5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTD2Q9H8S5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTD2Q9H8S5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTD2Q9H8S5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTD2Q9H8S5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTD2Q9H8S5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTD2Q9H8S5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTD2Q9H8S5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTD2Q9H8S5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTD2Q9H8S5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTD2Q9H8S5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTD2Q9H8S5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNTD2Q9H8S5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTD2Q9H8S5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTD2Q9H8S5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTD2Q9H8S5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTD2Q9H8S5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTD2Q9H8S5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTD2Q9H8S5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTD2Q9H8S5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTD2Q9H8S5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTD2Q9H8S5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTD2Q9H8S5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTD2Q9H8S5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTD2Q9H8S5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTD2Q9H8S5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTD2Q9H8S5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTD2Q9H8S5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms